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蛋白组学
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项目简介
一、项目介绍
蛋白质组学(Proteomics)，是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。主要是利用高分辨蛋白质分离技术和高效的蛋白鉴定技术，在蛋白质水平上整体、动态以及定量地研究生命现象和规律，是系统生物学的有机组成分。目前科学指南针提供TMT、iTRAQ、Label free、靶向蛋白组学等多种蛋白质组学技术，这些技术广泛应用于蛋白质的定性和定量分析。
二、交付内容
检测报告（含测试流程，仪器型号等），交付时间4-6周，根据实验进展定，可能会变化。
结果反馈请在测试完成一周内反馈给指南针工作人员。
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结果展示
样品要求
送样要求
https://drive.weixin.qq.com/s?k=AO0AWwf-AAwGdyKqTH（点击查看）。
寄样要求
1. 样品管上名称和表中样品编号务必保持一致，除名称以外，请勿将其他信息标记于管盖，以避免出现可能的识别错误，后续分析报告按样品编号输出。
2. 锡纸包装的组织样品，将样品名称写在标签纸上并和样品一起装入塑封袋中，避免低温冰冻造成的样品名称无法识别。
3. 样品量要求具体和项目经理确认。
常见问题
1. TMT、LFQ和DIA三种技术有何区别，分别适用于哪些样本类型？
TMT、LFQ和DIA是目前最常用的三种基于质谱的高通量蛋白质组学定量方法。
TMT（Tandem Mass Tag，串联质量标签）方法的主要特征是在样品制备环节使用稳定同位素标记试剂与样品的酶解肽段进行反应，使待定量的肽段被标记上由多个基团组成的等质量标签，并在随后的检测中基于标签基团的信号进行多肽和蛋白的定量。
LFQ（Label Free Quantification，非标记定量）方法的主要特征是在样品制备环节无需稳定同位素标记，直接以肽段的检测信号进行肽段和蛋白的定量分析。
DIA（Data-independent Acquisition，数据非依赖性采集）方法的主要特征是其在采集质谱二级谱图时，并非基于一级谱图采集信号强度较高的肽段离子产生的二级谱图，而是根据所有离子质荷比范围划分窗口后依次采集所有肽段离子的二级谱图。
由此可见，三种方法是基于其在样品制备和谱图采集层面的主要特征来命名和划分的。
三种技术方法都可以进行高通量的蛋白质组学定量分析，理论上可以相互替代。但由于方法原理不同，这三种定量技术在实际应用中也存在不同的表现和偏向，因此针对不同的研究设计和样品类型，我们通常建议采用不同的定量方法，总结出如下面三种高通量蛋白质组技术的应用表现差异汇总表。
