【摘要】 大多数RNA从最初的转录到最终的降解,都依赖于其与多个RNAbding Proteins(RBP)的相互作用。

大多数RNA从最初的转录到最终的降解,都依赖于其与多个RNAbding Proteins(RBP)的相互作用。为了在细胞内执行特定功能,单链(ss)或双链(ds)RNA需要被RBP特异性靶向,以形成不同大小、组成和复杂性的核糖核蛋白(RNP)复合物。这些RNA-蛋白质组件通过mRNA剪接和加工、RNA编辑和修饰、RNA输出和细胞质运输、翻译控制、RNA质量和稳定性控制、降解、外壳组装等过程,在转录后调控基因的表达。人体内所有细胞的行为都是由RNA-蛋白质相互作用网络协调的,正因如此,RNP功能失调通常会导致人体发生疾病。为了使RNA-蛋白质相互作用的功能合理化,科学界需要在原子水平上确定RNA和蛋白质之间结合的性质,在分子水平上理解的许多细胞功能,因此急需要一种测试手段来对RNP的结构进行研究。

古往今来,核磁共振(NMR)一直对研究单个RNA结合域及其与RNA基序的相互作用提供了重要的支撑,为RBP对RNA的识别提供了重要见解。当前,为了扩展科学界对RNP功能的理解,需要综合结构生物学的方法来破译大型RNP组件的结构和动力学。这对X射线晶体学和冷冻电子显微镜来说是一个挑战,但核磁共振将在这一过程中发挥重要作用。

Deepak等人对具有不同标记方案的RNA-蛋白质组装体进行设计和制备,同时论述了采用PRE、EPR、RDC和SAXS等检测方式的优缺点,还讨论了NMR测量与MD模拟相结合的更大的RNA-蛋白质组装体的核磁共振结构测定的最新进展。

 

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