【摘要】 宏基因组学(Metagenomics)又称微生物环境基因组学、元基因组学,主要研究从环境样品获得的基因组中所包含的微生物的遗传组成及其群落功能。

宏基因组学(Metagenomics)又称微生物环境基因组学、元基因组学,主要研究从环境样品获得的基因组中所包含的微生物的遗传组成及其群落功能。在微生物学研究领域中,因为绝大部分微生物都难以培养,过去人们对微生物世界的认识基本上都集中在不到1%的微生物上。宏基因组学的研究对象不需要进行培养,避免了传统微生物学基于纯培养研究的限制,可以最大限度地挖掘微生物资源,已经成为国际生命科学技术研发最重要的热点和前沿。

 

宏基因组学直接进行微生物基因组测序或16S rRNA的PCR产物测序,大大加快了研究的速度,降低了研究的费用。Qin等人研究了345名中国二型糖尿病患者的的肠道菌群,结果表明,与正常人相比,患者肠道菌群失调,生成丁酸盐的菌群减少,而条件致病菌的数量增加。Fei等人对一个严重肥胖症患者进行了研究,该患者除肥胖外,还伴有糖尿病和高血压,通过使用中药和益生元(prebiotics)治疗,9周以后体重减轻了30.1kg,23周后减轻了51.4kg。对患者治疗前、后的肠道菌群进行新一代测序发现,该患者肠道内分泌脂多糖内毒素的肠杆菌数量大大降低,治疗后在肠道内几乎无法测出。将患者体内分离出的阴沟肠杆菌接种到无菌状态的C57BL小鼠体内,可以诱导其肥胖,并出现胰岛素抵抗现象,说明脂多糖内毒素与肥胖和糖尿病有相关性。

 

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