【摘要】 分子模拟方法整理和总结
学习到这里,相信同学们对分子模拟也有了一定的了解了,但前面都讲的较为零散,因此从这一期开始我们就对这些方法进行专门的整理和总结。
量子力学(Quantum Mechanics, QM) 方法:
量子力学方法是以研究分子中电子的非定域化为基础,一切电子的行为以波函数表示。此方法借助计算分子结构中各微观参数,如电荷密度、键序、轨道、能级等与性质的关系,设计出具有特定动能的新分子。该法所描述的是简单的非真实体系,计算的是绝对温度零度下真空中的单个小分子。最为普遍的量子力学计算方法为从头算计算法(ab intio method)。随后发展了一些较为简便的半经验分子轨道计算法(semi- empirical molecular orbital method),这些计算方法多引用一些实验值为参数,以取代计算真正的积分项。其中从头算量子力学计算广泛用于计算平衡几何形状、扭转势以及小分子的电子激发能。随着计算机硬件和算法的发展,已将此技术用到大分子,包括聚合物的低聚物在内的模型,并有较好的效果。
通过上文,我们可以知道量子力学的方法适用于简单的分子,或电子数量较少的体系。
但是在自然界与工业上的许多系统中,比如聚合物(脂肪、橡胶、安全玻璃等等)、生化分子(核酸、酶、蛋白质、多糖类等)、合金材料等均含有大量的原子及电子。对于金属材料、聚合物材料、浓稠溶液、固态混合物、纳米材料等系统,我们不需要了解单一分子的性质及分子间的相互作用,我们需要了解的是整个系统的各种集合的性质、动态行为与热力学的性质。对于这样的复杂体系,因其含有的电子数目较多,量子力学方法就无法完成其计算任务。因此就有了我们接下来要讲的非量子力学计算方法的出现,利用这些非量子力学的计算方法可以解决许多复杂系统的问题,并得到相当精确的结果。
参考文献
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