【摘要】 微量生物医学样品的蛋白质组学分析可以揭示细胞异质性，促进基础研究。

微量生物医学样品的蛋白质组学分析可以揭示细胞异质性，促进基础研究。目前，基于抗体的方法，如细胞计数(CyTOF)和单细胞Western blotting (scWB)提供了增强的多重蛋白检测，但这些方法仅限于量化几十种蛋白质。液相色谱(LC)和串联质谱(MS/MS)可以鉴定和量化哺乳动物细胞中的数千种蛋白质(单个哺乳动物细胞通常含有100 pg ~ 1 ng蛋白质。ctc是存在于非转移性和转移性癌症患者外周血中的微量细胞，是癌症监测、预后和诊断的重要参数。由于循环肿瘤细胞(循环肿瘤细胞)的罕见性，对循环肿瘤细胞的蛋白质组学分离和分析具有挑战性。然而，对于传统的无标记定量(LFQ)蛋白质组学分析来说，获得的细胞数量太少。

无标签蛋白质组学与痕量临床样品提供了丰富的可操作的见解，个性化医疗。临床获得的原代细胞，如循环肿瘤细胞(ctc)，通常丰度较低，无法进行常规的无标记蛋白质组学分析。在这里，Wang等人[1]提出了一种镰刀状惯性微流体系统，用于在线稀有细胞分离和串联无标记蛋白质组学(即orcs -蛋白质组学)。orcs -蛋白质组学采用0.1% n -十二烷基β-d-麦芽糖苷(DDM)、1 mM Tris(2-羧乙基)膦(TCEP)和2 mM 2-氯乙酰胺(CAA)的缓冲体系进行细胞裂解和还原烷基化。orcs -蛋白质组学在293T细胞中的应用，并分别在4、13、68和119个细胞中鉴定出913、1563、2271和2770个蛋白质组。然后我们用白细胞(wbc)刺穿MCF7细胞来模拟患者的血液样本。orcs -蛋白质组学鉴定了2000多个蛋白质组，平均有61个MCF7细胞。我们进一步招募2例晚期乳腺癌患者，通过微创抽血分别采集5例和7例ctc。Orcs-proteomics为每位患者鉴定出973和1135个蛋白质组。因此，Orcs-proteomics可以同时对罕见细胞进行分离和蛋白质组学计数，为罕见原发患者样本的个性化治疗决策提供技术支持。

[1]Sickle-like Inertial Microfluidic System for Online Rare Cell Separation and Tandem Label-Free Quantitative Proteomics (Orcs-Proteomics)[J].Analytical chemistry, 2022(15):94.

 

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