【摘要】 实现了一种基于梯度的过渡状态搜索算法,该算法使用高斯过程回归。
研究反应机理是理论化学的中心目标。任何反应都可以用它的势能面(PES) E(x)来表征,其能量取决于所有原子的核坐标。PES上的最小值对应于反应物和生成物。最小能量路径,连接两个最小值的最低能量路径,可以看作是平均反应路径的近似。它通过一个一阶鞍点(SP)。这样的SP是沿着最小能量路径的能量最高的点。最小值与连接最小值的SP之间的能量差为反应势垒,可用于过渡态理论中计算反应速率常数。
在这里,Alexander Denzel等人[1]提出了一个基于机器学习技术的算法。实现了一种基于梯度的过渡状态搜索算法,该算法使用高斯过程回归。这项工作中提出的基于P-RFO的优化技术在没有Hessian信息的情况下定位SP。它在高斯过程回归(GPR)方法中使用能量和梯度信息。这使其能够在插值PES上使用P-RFO,该插值PES的评估成本比原始PES低得多,而无需在原始PES上计算Hessians。
基于核的方法,如GPR,越来越多地用于理论化学中预测不同种类的化学性质。其中包括PES上的最小化算法,在某些情况下,甚至不需要分析梯度。特别有趣的是,GPR已经被用于搜索SP:使用GPR大大提高了轻推弹性带方法(NEB)的效率。与该方法相比,实验中使用了表面行走算法,专注于SP,而不是优化整个路径。
除了对算法的描述外,研究中还提供了一种方法,如果只知道反应物和产物的最小值,就可以找到优化的起点。在27个测试系统上针对二聚体方法进行了基准测试,并在DL-FIND库中实现了分区有理函数优化。研究发现新的优化器可以显著减少所需的能量和梯度评估次数。
[1] Denzel A , Kstner J .Gaussian Process Regression for Transition State Search[J]. 2020.DOI:10.1063/1.5017103.
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