【摘要】 分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。

分子动力学（Molecular Dynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程。分子动力学模拟是理论计算和实验方法的有力补充，广泛应用于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。

适合的研究方向包括但不限于：生物、生化、医药、医学、药物、高分子、食品、材料、环境等

可以计算的体系包括但不限于：生物体系、蛋白质、核酸、多肽、药物分子、聚合物、小分子等。常用软件主要有：gromacs，lammps，amber等。

蛋白-小分子对接确定活性位点结果示例

有限元法(Finite Element Method, FEM)是一种将连续体视为若干个有限大小的单元 体的离散化集合，以求解连续体热、力、电磁问题的数值方法，其基本思想是将连续的求解区域离散为一组有限个、且按一定方式相互连接在一起的单元的组合体。

适合的研究方向包括但不限于：机械、土木、工艺、工业、工程、光学、声学等

常用软件主要有：comsol，ansys，abaqus，fluent等。

流体相关模拟结果示例

 

相分析法：常用软件：thermocacl，factsage等

 

可以计算的内容包括但不限于：

 

相图、平衡组分、热化学计算等模拟

相图模拟结果示例

 

半导体器件仿真适合的研究方向包括但不限于：电池、半导体、化工、光学、声学等

半导体激光器模拟结果示例

 

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