【摘要】 动画可以比文字更详细、更精确地捕捉多种生物活动。
3D 动画是将复杂且通常不同的科学数据集成到无缝且引人入胜的故事中的理想技术。除了精美动画在教育和交流中广为接受的作用之外,迭代创作过程还在科学家构思、讨论和理解复杂动态过程的方式中发挥着重要作用。因此,开发和修改科学动画可以帮助建立共识模型。
动画可以比文字更详细、更精确地捕捉多种生物活动。然而,科学动画有一个重大且固有的弱点:它们缺乏透明度。通过观看动画,很难区分有充分实验证据的片段和主要基于猜测的片段。
随着动画作为科学和公共交流的一种手段变得越来越普遍,考虑提高动画透明度的方法变得越来越重要[1],既可以描述动画师做出的创造性选择,也可以描述各种数据源。
例如SARS-CoV-2 进入宿主细胞的机制相对较好地了解,但对于生命周期的后期阶段仍知之甚少。不确定性的一个主要问题是双膜囊泡的形成,这种结构源自宿主内质网膜,病毒基因组的复制和转录被认为在其中发生。
我们决定在亚细胞水平而不是分子水平上并行展示几种可能的机制,以更好地反映当前的知识状态。病毒转录机制是研究界在制作动画时尚未达成共识的另一个话题。我们通过文献综述确定了 2 个相互矛盾的假设并与专家讨论,并决定通过 2 个独立的动画独立地可视化这些内容。
除了这些具有重大不确定性的领域之外,我们还必须填补其他知识空白才能创建完整的动画。例如,文献中尚未清楚地描述多蛋白加工和非结构蛋白插入内质网膜的机制,应被视为推测性的。此外,虽然动画中使用的一些分子结构是通过实验解决的,但其他分子结构代表了计算预测。
[1]Iwasa JH. Animating the model figure. Trends Cell Biol. 2010;20(12):699–704. pmid:20832316
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