【摘要】 在代谢组学中,非靶向液相色谱-质谱(LC-MS)代谢组学技术广泛应用于临床研究。
近年来,由于牧场规模的不断扩大,蹄病的发病率不断上升,蹄变形是奶牛常见的蹄病之一。蹄变形的发生与地理位置、气候、饲养管理、矿物元素、疾病和血液流变学等多种因素有关。
在代谢组学中,非靶向液相色谱-质谱(LC-MS)代谢组学技术广泛应用于临床研究。离子组学是一种用于研究测试样品中离子的组成、分布和积累的技术。电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)是最常用的基于质谱的元素分析方法,用于同时检测多种元素,它可以与其他色谱分离技术一起用于元素价和同位素分析。
在Chaoyang Deng等人[1]的工作中为了探讨蹄畸形牛的代谢和离子变化,采用LC-MS/MS和ICP-OES/MS对10头健康牛(C组)和10头蹄畸形牛(T组)的血清样品进行了分析。通过筛选和鉴定差异代谢产物和离子,并使用生物信息学方法分析差异代谢产物的途径富集。用R语言的ggplot2软件分析代谢组学和离子学的整合,并通过MRM靶代谢组学进行验证。
图1 T组(疾病组)与C组(健康组)血清中差异离子的匹配图(PS:横轴显示了对数转换后的褶皱变化值。红色表示上调,蓝色表示下调,点色调表示VIP值)
ICP-OES/MS结果显示13个离子显著上调,18个离子显著下调。对筛选出的差异离子进行匹配图分析(图1)。离子的定量值被计算为欧几里得距离矩阵,以通过完全链方法对代谢物进行聚类。结果显示为热图(图2)。
图2 T组和C组血清中差异离子的层次聚类分析热图(PS:图中的水平坐标表示不同的奶牛,垂直坐标表示离子,颜色表示离子的相对水平,红色表示高含量,蓝色表示低含量)
结果表明,代谢组学筛选出127种代谢产物,其中81种上调(p<0.05),46种下调(p<0.05)。
ICP-OES/MS结果显示,奶牛血清中K、Li、Pb等13种离子上调,Al、Cu、Sb等18种离子下调。代谢组学和离子学的综合分析发现,钾离子与L-酪氨酸、L-脯氨酸、硫胺素和L-缬氨酸呈正相关。钠离子与L-缬氨酸呈正相关,与α-D-葡萄糖呈负相关。高通量靶代谢组学结果显示,奶牛血清中L-脯氨酸、L-苯丙氨酸和L-色氨酸含量显著升高,与非靶代谢组的结果一致。
总之,代谢组学和离子学揭示了蹄变形奶牛的代谢和离子变化。
[1] Deng, C.; Yue, Y.; Zhang, H.,Liu, M.; Ge, Y.; Xu, E.; Zheng, J. Serum Metabolomics and Ionomics Analysis of Hoof-Deformed Cows Based on LC-MS/MS and ICP-OES/MS. Animals 2023, 13, 1440. https://doi.org/10.3390/ani13091440.
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