【摘要】 ovito是一款强大的lammps后处理软件，带可视化功能。有时候，程序运行完毕，我们很关心某些“group”的运动轨迹，这时候ovito可派上用场。

ovito是一款强大的lammps后处理软件，带可视化功能。有时候，程序运行完毕，我们很关心某些“group”的运动轨迹，这时候ovito可派上用场。

 

还是以水液滴蒸发模型为例，如下图所示

 

 

第一步——选择关心的原子集合

 

1.打开ovito程序，File - Load File，加载lammps的dump文件；

 

2.右上角，Add modification - Select type，选择Type 3（即N元素）；

 

 

3.Add modification – Delete selected，将N元素删除，只显示我们关心的水分子；

 

 

4.Add modification – Manual selection，或者更复杂一些，通过多次选择的交、并、补选择了复杂的原子集合。这里，我选择了水液滴表面部分水分子，如图所示：

 

 

 

第二步——“冻结”所选择的原子的颜色属性

 

1.Add modification – Freeze property，在Property on下拉列表选择Selection；

 

 

2.Add modification – Assign color，为该原子集合指定颜色，需要与周围原子有一定的区分度；

 

 

 

第三步——播放动画，追踪选择的原子运动轨迹

 

 

 

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