【摘要】 大家在看关于GCMC的相关资料的时候有没有注意到问题，这个模拟过程中相关工具都是把吸附剂材料和吸附质作为刚性存在的（默认设置下）。

大家在看关于GCMC的相关资料的时候有没有注意到问题，这个模拟过程中相关工具都是把吸附剂材料和吸附质作为刚性存在的（默认设置下）。而实际的实验中，吸附质是能够改变其结构去适应吸附剂的。


举个例子，有一根弯曲铁丝插在了沙子中，此时假设铁丝瞬移到了你手里，结构不变。你再去用蒙特卡洛方法想脚下的沙子中找一个可以放置该铁丝的空间，这个过程会很困难。蒙特卡洛方法对于高密度下复杂分子的插入研究是很困难的。

 

此时有没有想过，如果这个铁丝能够自己找个点开始生长，然后根据沙子实际的孔径连通情况自己扭转生长，敌不动我动。

 

那么现在就要引出主题了，有上面插铁丝研究需求的同学老师们，可以关注一下Configurational bias Monte Carlo（CBMC） 中文应该是译作构型偏倚蒙特卡洛，也许还有其他更好地译法。

 

如果大家研究的体系是吸附惰性气体，吸附甲烷、氮气、苯这类的物质，那么这个技术对于大家的研究基本没啥帮助，主要是针对吸附质为柔性复杂分子的吸附研究有着重要的意义。

 

目前发现DICE、RASPA、Cassandra和MS-sorption都确定能做这个模拟。当然，其他的成熟的MC工具应该都有相关的考量，不然只靠Metropolis也不好意思出来混。

 

DICE作者在其软件首页重点提出自己可以做CBMC，应该是专长做这个模拟的。

 

https://portal.if.usp.br/dice/

 

RASPA也支持该技术，当然要对着手册好好研究一下。可以在手册中搜索CBMC直达。

 

https://iraspa.org/raspa/

 

Cassandra是常用蒙特卡洛研究工具，也可以做这个研究，软件有官方的workshop挂在官网，但是其他的学习资源比较少，手册中有CBMC相关说明。

 

https://cassandra.nd.edu/index.php/documentation

 

MS-sorption中使用该方法只需要在Method中切换到Configurational bias就可以进行相关设置。不得不感叹，MS确实拉低了搞计算的门槛。

 

 

个人建议大家在进行CBMC模拟之前，先仔细了解一下相关参数的含义，这样才能在切换到不同软件的时候能够不懵。推荐阅读一下DICE软件的官方文章：

 

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.0c00077

 

本期推送资源没有附件，只是提供了一个研究的思路。相关资源大家可以在给出的相关链接直接获取得到。

 

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