【摘要】 用VASP无论是结构优化还是AIMD，都会产生轨迹文件XDATCAR，通过可视化该文件可以明确的知道原子位置时如何变化的。

 

用VASP无论是结构优化还是AIMD，都会产生轨迹文件XDATCAR，通过可视化该文件可以明确的知道原子位置时如何变化的。XDATCAR可视化软件有VMD和ovito等。今天给大家介绍如何用ovito来可视化XDATCAR文件。

 

1.读取XDATCAR

 

打开ovito软件后，可以通过2种方式读取XDATCAR文件：

 

1.File-Load File;

2.把XDATCAR直接拖进ovito中。

 

 

2.设置合适的原子半径以及生成共价键

 

设置原子半径在右上角的Particle types，如下图：

 

 

ovito默认不显示共价键，如果需要显示共价键，通过Add-modification-Create bonds设置，这里显示O-O和O-H键。

 

 

3.选取合适的视角

 

ovito预置了几种常用视角，通过点击左上角进行View type设置，有Top、Bottom、Front、Back、Left、Right等，也可以用鼠标进行旋转。

 

 

4.输出动画

 

设置完成后，在右上角的Render选项卡，选择Complete animation（或者设置动画范围），勾选Save to file，选择gif格式，设置背景颜色，最后点击Render active viewport即可得到gif格式的动画。

 

 

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