【摘要】 植物的生长发育不仅受自身基因遗传因素的调控,还受到环境胁迫、内源激素变化等影响,其中转录因子在植物的生物钟调控、激素信号转导、生长和代谢等过程中发挥重要作用。

植物的生长发育不仅受自身基因遗传因素的调控,还受到环境胁迫、内源激素变化等影响,其中转录因子在植物的生物钟调控、激素信号转导、生长和代谢等过程中发挥重要作用。染色质免疫共沉淀技术(chromatin immunoprecipitation,ChIP)可以利用目的蛋白特异性抗体与可溶性染色质免疫共沉淀,特异性地富集目的蛋白结合的DNA,并可利用染色质免疫共沉淀与测序相结合的ChIP-seq技术,检测植物转录因子结合位点、组蛋白修饰分布,有效地完成植物基因表达情况的研究。

 

GRF7(growthregulating factor 7)是水稻生长调节因子类转录因子,Chen等人选用不同发育时期的水稻幼穗进行ChIP-seq检测,发现OsGRF7与细胞色素P450基因OsCYP714B1和生长素响应基因OsARF12启动子中的ACRGDA motif结合,激活基因转录,参与赤霉素的合成和生长素的信号传导途径,调控幼穗发育。

 

CAA1(circadian clock-associated 1)是拟南芥(Arabidopsis thaliana)生物钟重要转录因子,PRRs家族基因参与生物钟调控,Kamioka等人通过ChIP-seq发现CCA1直接结合在基因PRR5的启动子区域,抑制PRR5表达,并发现CCA1与PRR9、PRR7、PRR5等基因启动子上多个motif结合,包括G-box、EEs、CT重复、TCP等,调控生物钟周期。

 

油菜素内酯(brassinosteroid,BR)是植物重要的促生长类激素。BR促进细胞伸长与分裂,对水稻叶夹角发育有影响,Guo等人通过ChIP-seq分析发现,水稻bHLH(basic-helix-loop-helix)转录因子家族的OsbHLH98,结合水稻BR信号转导途径相关基因BUL1的启动子上的G-box、E-box等motif,抑制基因表达,调控水稻叶夹角发育。

 

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