【摘要】 分子动力学（Molecular Dynamics，MD）是一门结合物理，数学和化学的综合技术。

分子动力学（Molecular Dynamics，MD）是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，从分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步去计算体系的热力学性质和其他的一些宏观性质。简单来讲分子动力学是在经典力学框架下，给定其初始位置和速度，对分子体系时间演化（动力学）的模拟，其本质上就是在计算机里进行一个well-controlled实验。

 

➢分子动力学特点：

  1. 分子水平的模拟
  2. 以分子的运动为主要模拟对象，
  3. 采用经验性的分子间作用函数模拟微粒之间的作用”
  4. 一般情况下不考虑电子转移效应，因而不能准确模拟化学成键作用

 

发展历程

最早是在1950s， Alder, 劳伦斯利物默实验室，分子动力学模拟了32个原子；

1950s, Metopoli,, 洛斯阿洛莫斯实验室，蒙特卡洛模拟了32个原子

1980年：恒压条件下的动力学方法提出；

1983年：非平衡态动力学方法(Gillan and Dixon)提出；

1984年：恒温条件下的动力学方法提出；

1985年：第一性原理分子动力学法提出；

1991年：巨正则系综的分子动力学方法(Cagin and Pettit)。

 

应用领域

分子级别的模拟应用的领域很广，分子动力学广泛应用于化学，物理，生物，化工，材料，机械，治药等领域，其简单易上手的模拟方法也受到了广大研究人员的欢迎。

 

参考文献

[1] 樊康旗,贾建援.经典分子动力学模拟的主要技术[J].微纳电子技术,2005,42(3):133-138.

 

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