【摘要】 圆二色谱(CircularDichroism,简称CD)单位定义为ellipticity(椭圆率),meanresiduelipticity一般用于蛋白质文献[θ](化合物也被用作molarelipticity[θ])表示单位是deg.cm2.dmol-1。
由于历史原因,圆二色谱(CircularDichroism,简称CD)单位定义为ellipticity(椭圆率),meanresiduelipticity一般用于蛋白质文献[θ](化合物也被用作molarelipticity[θ])表示单位是deg.cm2.dmol-1。
我们在实验中检测圆二色谱时获得的CD谱数据通常以毫度mdeg(Y轴)表示,其对应的横轴(Xaxis)为波长nm。很多人无计可施,不知道如何在不同的CD单位之间转换。更重要的是,他们甚至混淆了这两个数据。
Molarellipticity[θ]转换mdeg的方法
[θ]=deg.cm2.dmol-1
根据Beer-Lambertlaw:
mdeg=[θ].l.c或[θ]=mdeg/(l.c)
其中,l是光径(mm)、样品浓度为c(mM)。
因此,单位之间可以这样转换:
mdeg/(mm.mM)=(1/1000)deg/(mm.mM)=(1/1000).deg/(1/10cm.1/1000000mole/cm3=(1/1000).deg(1/1000000mole/cm2)=(1/1000).deg(1/1000000dmole/cm2)=(1/1000).deg(1/1000000dmole/cm2)=1000/(1/1000000000)deg.cm2.dmol-1=1000deg.cm2.dmol-1
换句话说,用公式[θ]=mdeg/(l.c)计算出的值可以乘以1000转换为deg.cm2.dmol-1。
再通俗点,将实验中测定的mdeg值乘以1000除以光径(mm)再除以浓度(mM)所得值为molarellipticity[θ](单位deg.cm2.dmol-1)
对于蛋白质,使用meanresiduelipticity。因为meanresiduemolecularweightig。=proteinformulaweight/numberofresidues,因此,上述方法计算的数值最终应除以蛋白质残留的数量。
摩尔圆二色性(molarcirculardichroism)与摩尔椭圆率(molarellipticity)
摩尔圆的二色性是摩尔消光系数的差值(deltaepsilon),即:
Δε=εLCP-εRCP
当CD光谱在分子模拟中通过高斯理论计算时,结果通常是摩尔圆二色性Δε表示。Δε与摩尔椭圆率(molarellipticity)[θ]两者之间的转换公式为:
[θ]=3298.2Δε
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